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表观遗传之DNA甲基化<二>

发布者:艾美捷科技发布时间:2020-10-10

      上周我们给大家讲解了一下什么是表观遗传和什么是DNA甲基化, 也给大家推荐了适用于DNA甲基化研究的产品:。想必有不少同学很想知道,还有没有其他甲基化DNA研究的试剂盒,因为同学们对DNA甲基化的研究可不仅仅局限于定量的检测。

 

甲基化DNA研究

      今天就给大家带来期待的第二波产品。

 

       一、DNA甲基化修饰相关产品

 

       DNA甲基化修饰研究手段——DNA亚硫酸盐转化,使用亚硫酸氢钠将胞嘧啶转化为尿嘧啶,而5-甲基胞嘧啶(5-mC)保持完整。 即未甲基化的胞嘧啶残基被脱氨成尿嘧啶,甲基化的胞嘧啶(5-mC)残基不受影响,这使PCR扩增可将尿嘧啶视为胸腺嘧啶,将5-mC或5-hmC识别为胞嘧啶。 这样便能够区分甲基化和未甲基化的胞嘧啶残基,从而提供有关DNA甲基化区域的单核苷酸分辨率信息。

 

DNA甲基化修饰

 

      要成功地进行DNA甲基化研究,必须进行完全转化,并减少通常由于严酷的化学反应而导致的DNA降解量。基于亚硫酸氢盐和亚硫酸氢钠的方法是用于研究DNA甲基化并帮助制备基因组DNA进行基因特异性DNA甲基化分析的常用方法。 亚硫酸氢盐转化后通常是下游应用,在基因特异性基础上分析DNA甲基化的流行下游方法包括亚硫酸氢盐测序,甲基化特异性PCR(MS-PCR)和基于甲基化的微阵列。

 

      整个转换过程中,高质量的DNA是至关重要的,因为转换过程中的酸性物质会破坏DNA。而对于大规模亚硝酸氢盐转化实验,高通量选择对于节省时间和降低成本至关重要。那么如何选择合适的产品呢?小编给大家推荐推荐。

 


Methylamp DNA Modification Kit
Cat #P-1001
BisulFlash DNA Modification Kit
Cat #P-1026
Methylamp Whole Cell Bisulfite Modification Kit
Cat #P-1016
代码名称 “经典” “快速” “直接”
目的 基于化学的DNA亚硫酸氢盐转化 基于快速热基的DNA亚硫酸氢盐转化 直接从细胞,组织,唾液,尿液或血液中转化
关键点 1. 兼容Illumina工作流程
2. 最坚固可靠
3. 亚硫酸氢盐测序,NGS和各种MSP的理想选择
1. 极快
2. 实时MSP的理想选择
3. 可选的测序方案
1. 消除了分离DNA的步骤
2. 非常适合包含少量DNA的样品
起始原料 DNA DNA 细胞,组织,血液
最低输入量 50 pg 200 pg 100 细胞, 1 µl 血液
操作总时长 < 2 h 30 min < 3 h
洗脱体积 8-20 µl 10-20 µl 8-20 µl
转换效率 99.9% 99.9% 99.9%
脱硫/净化
回收率 >75% >75% >85%
转换后DNA片段大小 200-2000 bp; Avg. Peak of 800 bp 100-400 bp; Avg. Peak of 250 bp 200-2000 bp; Avg. Peak of 800 bp
形式 旋转柱 旋转柱 旋转柱

 

      此外,还有高通量DNA修饰试剂盒,EpiNext高灵敏度亚硫酸氢盐测序试剂盒(Illumina),一步法DNA修饰试剂盒,Methylamp通用甲基化DNA试剂盒,Methylamp全细胞亚硫酸氢盐修饰试剂盒等产品,满足您的各种需求哦,感兴趣的话,请联系小艾吧!

 

       二、甲基化DNA PCR & NGS 分析试剂盒

 

     面我们了解了DNA甲基化修饰相关的产品,也了解了DNA经过修饰后适用于下游分析:如亚硫酸氢盐测序、甲基化特异性PCR(MS-PCR)和基于甲基化的微阵列。是不是认为找产品太麻烦了?其实不麻烦,因为Epigentek同样有配套产品供大家选择,方便大家的实验哦。

 

货号 产品名称 描述
P-1028 Methylamp MS-qPCR Fast Kit 1. 热启动DNA聚合酶与优化的缓冲液结合可确保MS-qPCR的特异性和敏感性。
2. 绿色染料无需使用序列特异性探针即可进行DNA检测和分析。

P-1056A EpiNext High-Sensitivity Bisulfite-Seq Kit (Illumina) 1. DNA同时被亚硫酸氢盐转化并在亚硫酸氢盐过程中片段化为适当的长度。
2. 然后将单链形式的经亚硫酸氢盐处理的DNA同时转换为dsDNA,并进行衔接子连接。
1. 选择片段的大小,并用MQ珠进行纯化,从而可以快速,精确地选择DNA的大小。
2. 然后使用高保真PCR混合物扩增大小选择的DNA片段,从而确保从最小量的起始原料中获得最大产量,并以低错误率和最小偏差提供高度准确的文库DNA扩增。
P-1055 EpiNext Post-Bisulfite DNA Library Preparation Kit (Illumina) 1. 将经过亚硫酸氢盐处理的DNA(单链形式)转换为双链DNA,并直接用于与BisDNA特异性衔接子连接,这对于扩增和测序是必不可少的
p-1051 EpiNext DNA Library Preparation Kit (Illumina) 1. 首先将DNA片段化为合适的大小(约300 bp的峰大小)。 进行DNA片段的末端修复,并在每条链的3'末端添加一个A突出端。
2. 然后将衔接子连接至末端修复/ dA尾部DNA片段的两端,以进行扩增和测序

 

      想了解更多,请咨询小艾哟~~

 

         三、甲基化DNA免疫沉淀

 

      甲基化DNA免疫沉淀(meDIP)是一种基于抗体的大规模技术,用于富集和捕获甲基化DNA片段,可用于在基因组范围内进行基因特异性DNA甲基化研究。 遵循meDIP方法,可以使用多种下游应用程序分析DNA甲基化,包括meDIP-PCR,meDIP-ChIP和meDIP测序。

 


Methylamp甲基化DNA捕获(MeDIP)试剂盒
Cat #P-1015
EpiQuik羟甲基化DNA免疫沉淀(hMeDIP)试剂盒
Cat #P-1038
EpiQuik MeDIP Ultra KitCat #P-1052 EpiQuik甲基化DNA免疫沉淀试剂盒
cat#P-2019
EpiQuik组织甲基化DNA免疫沉淀试剂盒
cat#P-2020
目的 富集并捕获甲基化的DNA片段 富集并捕获羟甲基化的DNA片段 从低起始输入中富集并捕获甲基化的DNA片段 直接从细胞裂解物中富集并捕获甲基化的DNA片段 直接从组织中富集并捕获甲基化的DNA片段
关键点 1. PCR和微阵列的理想选择
2.兼容Illumina工作流程
1. 与下游工作流程兼容,包括hMeDIP-PCR和hMeDIP-chip 1. MeDIP-Seq的理想选择
2.兼容Illumina
3. 工作流程
最敏感和最具体
1. 通过直接从细胞中免疫沉淀meDNA片段2. 消除了DNA分离步骤 1. 通过直接从组织中免疫沉淀meDNA片段2. 消除了DNA分离步骤
起始原料 DNA DNA DNA 细胞 组织
最低输入量 0.2-1 µg 0.1 µg 50 ng DNA
(10,000 cells)
100,000 cells 10mg
操作总时长 < 3 hours < 3 hours < 3 hours < 4 hours <3.5h
富集效率 > 98% > 99% > 99% > 95% > 95%
转换效率 99.9% 99.9% 99.9% 99.9% 99.9%
包含高度特异性的抗体
包括DNA纯化柱
容器形式 96孔板 96孔板 96孔板 96孔板 96孔板

 

      我们来看看富集的效果,系列图分别对应p-1015,p-1038,p-1052

 

p-1015 p-1038 p-1052

 

       四、DNA甲基化抗体

 

      具有良好特征和高度验证的DNA甲基化抗体和DNA去甲基化抗体可能有助于提高研究人员对DNA甲基化及其在疾病、细胞周期调控和胚胎发育中的作用的理解。Epigentek DNA甲基化抗体可适用于多种实验,同时有各种规格的抗体供大家选择。

 

货号 产品名称 适用实验类型 反应性 形式
A-1018 5-Hydroxymethylcytosine (5-hmC) Monoclonal Antibody [HMC/4D9] DB, ELISA, hMeDIP, IF, IHC Broad Range IgG1
A-1014 5-Methylcytosine (5-mC) Monoclonal Antibody [33D3] DB, ELISA, IF, IHC, IP, MeDIP Broad Range IgG1
A-1001 DNMT1 Monoclonal Antibody [60B1220.1] ELISA, IF, IP, WB Human, Mouse IgG1
A-1002 DNMT2 Polyclonal Antibody IHC, WB Human, Mouse IgG

 

       以上就是今天为大家推荐的所有DNA甲基化方面的产品了,预知更多产品,可咨询小艾~~

 

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      作为一家具有高端的技术实力、先进的经营管理水平和完善的市场销售体系的生物高科技企业,总部位于武汉光谷高新技术开发区,服务面向全国。艾美捷科技是集进口试剂、实验室耗材销售、技术服务与合约开发为一体的专业化高科技公司,为用户提供专业的前沿资讯、完备的产品、整合的解决方案,及优质的物流服务。为了更好的服务客户,公司组建了一支经验丰富的研发团队-艾美捷生物技术中心,进入研发生产阶段,将更优质的产品推荐给国内生物领域的同仁们!

 

      艾美捷科技与国内外优秀的生物试剂供应商优保持着密切的合作关系,目前已成为众多国际知名品牌的中国总代理或一级代理,主要包括:AmyJet、AAT Bioquest、Abnova、Agrisera、Biovision、Biosensis、Cayman Chemical、Caisson Labs、Cytoskeleton、CytoNiChe、Epigentek、Equitech-Bio、Hycult Biotech、Jackson、LifeSensors、LigaTrap、ProSpec、Norgen Biotek、Mabtech、Matreya、iRegene、StressMarq、ImmunoReagents、SouthernBiotech、Origene、US Biological、Solis BioDyne等,可以在短时间内为用户提供专业的前沿资讯、完备的产品及物流服务。


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